Formation – Histologie : de la préparation d’échantillons à la validation des marquages par analyse d’image

Description of the training activity

OBJECTIFS
– Acquérir des bases théoriques et pratiques sur la préparation des échantillons pour la microscopie photonique (lumière visible et fluorescence) et la quantification du signal
– Savoir préparer un échantillon en histologie (coloration – immuno-marquage)
– Connaître les différents types de préparation en fonction de la question biologique posée
– Savoir adapter la préparation des échantillons pour une analyse du signal solide et reproductible
– Savoir reconnaître les artefacts de préparation les plus courants et savoir vérifier la qualité de ses marquages à l’aide de logiciels d’analyse d’image

PROGRAMME
La formation portera sur les préparations des échantillons pour la microscopie (de la prise en charge de l’échantillon jusqu’à la coupe sur lame) et les méthodes de vérification de la qualité des échantillons préparés en vue de leur quantification par analyse d’image. Les caractéristiques de préparation de différents types d’échantillons seront présentées (tissus durs – os -, biopsie, organe entier…) et mises en pratique.

EQUIPEMENTS
Microtomes ; cryostat ; automate de coloration ; serial block face ; scanner de lame (fond et fluorescence) ; microscope champ large et confocal ; ordinateurs avec QuPath et ImageJ Voir le site internet de la plateforme MicroPICell pour une description détaillée des équipements