Training

Virtual course: Course Overview

Correlative Light and Electron Microscopy (CLEM) allows precise localisation of an event of interest within cells and tissues. During this course, we will focus on a specific method that has been developed at EMBL that enables the location of fluorescent proteins with high accuracy at the ultrastructural level. The course will cover both the theory and practicals of high precision CLEM, as well as opportunities to discuss their research with CLEM experts and receive practical and troubleshooting advice.
Audience

This course is intended for scientists with experience in EM who want to further develop their skills in high-accuracy correlated microscopy.

Modules/Resources
The course will combine lectures and remote hands-on practical work covering all steps in the work flow including cryogenic sample preparation, ultramicroscopy, image registration and electron tomography.

Learning Outcomes
Participants will gain hands-on experience with the CLEM methods and learn tips from the people who developed the methods.

Vous avez entendu parler de la révolution du machine learning, mais ne savez pas par où commencer pour vous y mettre ?
Vous avez tenté d’utiliser des logiciels clé-en-main mais peinez à comprendre comment ils fonctionnent ?
Vous suivez avec minutie les tutoriels disponibles sur le net mais n’avez pas réussi à installer cette *** de bibliothèque qui débloquerait votre problématique de segmentation ?

Si au moins l’une de ces phrases décrit votre situation actuelle, l’ANF du RT-MFM “Machine learning pour les microscopies” est faite pour vous ! Elle vise à vous faire monter en compétence sur les problématiques de machine learning.
A l’issue de la formation, vous serez en mesure d’utiliser ces techniques dans votre activité quotidienne, mais aussi de partager les outils, savoirs et bonnes pratiques aux utilisateurs de votre plateforme.

Nous avons réuni la fine fleur du ML pour vous !
• Olivier Buri, Bioimaging and Optics Platform, EPFL
• Romain Guiet, Bioimaging and Optics Platform, EPFL
• Guillaume Jacquemet, The cell migration lab, Åbo Akademi University
• David Rousseau, Université d’Angers
• Daniel Sage, Biomedical Imaging Group, EPFL
• Bertrand Vernay, IGBMC

L’ANF se déroulera en 3 temps:
• Une pré-formation vidéo en amont pour acquérir des bases et un vocabulaire commun avec débriefing en visio;
• Une formation de 3 jours en présentiel à la Rochelle
• Un retour d’expérience post-formation sous la forme d’une table-ronde dédiée à MiFoBio

> Quand ?
Du mardi 19 (14h) au vendredi 22 octobre 2021 (12h)

> Où ?
Résidence La Fayette La Rochelle

> Pour qui ?
- BioImage Analysts en plateforme
- Participants maitrisant un language de scripting (Python, macros ImageJ …)
- Limité à 14 participants (une sélection des participants est prévue)
NB: la formation se déroulera sur les ordinateurs des participants

> Pour quoi ?
• Acquérir le vocabulaire
• Acquérir la maitrise des outils “clé-en-main”
• Repartir avec sa machine configurée
• Transférer ce savoir-faire

CNRS Workshop on Expansion Microscopy

Programme available here: https://sites.google.com/view/microscopie-par-expansion/programme

The event will take place from November 15 to 19, 2021 at the PFIC UMS AMMICa imaging Facility of Gustave Roussy.

Registrations are free but required.

The number of places being limited to 15 people, we will select the candidates according to their motivations.

The registration deadline is September 15, 2021.